Reticulate Evolution and Marine Organisms: The Final Frontier?

Hola,

Hace aproximadamente un mes salió este Review en International Journal of Molecular Sciences.

Aqui les copio el resumen y el link del documento PDF.

Saludos,

Dairo

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Michael L. Arnold & Nicole D. Fogarty 2009, 10(9), 3836-3860; doi:10.3390/ijms10093836

The role that reticulate evolution (i.e., via lateral transfer, viral recombination and/or introgressive hybridization) has played in the origin and adaptation of individual taxa and even entire clades continues to be tested for all domains of life. Though falsified for some groups, the hypothesis of divergence in the face of gene flow is becoming accepted as a major facilitator of evolutionary change for many microorganisms, plants and animals. Yet, the effect of reticulate evolutionary change in certain assemblages has been doubted, either due to an actual dearth of genetic exchange among the lineages belonging to these clades or because of a lack of appropriate data to test alternative hypotheses. Marine organisms represent such an assemblage. In the past half-century, some evolutionary biologists interested in the origin and trajectory of marine organisms, particularly animals, have posited that horizontal transfer, introgression and hybrid speciation have been rare. In this review, we provide examples of such genetic exchange that have come to light largely as a result of analyses of molecular markers. Comparisons among these markers and between these loci and morphological characters have provided numerous examples of marine microorganisms, plants and animals that possess the signature of mosaic genomes.

http://www.mdpi.com/1422-0067/10/9/3836

Ensamblando el Árbol de la Vida de los cnidarios

Hace cerca de cuatro años un grupo de colegas norteamericanos recibió por parte de la National Science Foundation (NSF) financiación para el proyecto que tenia como objeto armar la filogenia de los cnidarios (Cnidaria Tree-of-Life).  Los objetivos del proyecto incluían por supuesto tener una filogenia completa, al menos al nivel de género, de todos los cnidarios para lo cual se escogieron algunos genes ribosomales completos y sus modelos de estructura secundaria. Adicionalmente, se incluyeron una serie de estudios evolutivos que nos permitieran entender las diferentes novedades evolutivas presentes en este grupo como la presencia o ausencia de un estadio de vida libre o medusa y otros polimorfismos muy complejos presentes en este grupo de organismos diploblásticos. Los miembros del proyecto no resistieron la tentación de explorar las nuevas técnicas de secuenciación masiva y también se incluyeron algunos estudios de transcriptomas. Siendo el énfasis del proyecto la inferencia filogenética del grupo, tuvimos la oportunidad de colaborar dentro del proyecto estudiando los procesos filogenéticos entre especies cercanamente emparentadas tomando como grupo modelo a los octocorales. Hicimos un gran énfasis en el estudio evolutivo de una corta secuencias ribosomal transcrita pero no parte del ribosoma, el espaciador transcrito interno 2, con la cual reconstruimos una serie de historias evolutivas en octocorales tanto someros como de aguas profundas pero lo más interesante fue encontrar hipótesis de evolución reticulada en algunos casos lo cual es una  de nuestras líneas de investigación en biommar.

El proyecto se reunirá durante la conferencia de la Society of Integrative and Comparative Biology en Enero de 2010 en Seattle. Tendremos un simposio–Asembling the Cnidaria Tree of Life–durante un día completo dedicado al proyecto. Este simposio reúne los primeros resultados del proyecto y las charlas hacen parte de un numero de artículos tipo revisión que se someterán a la revista de la sociedad Integrative and Comparative Biology. Adicionalmente, estudiantes de los investigadores principales y colaboradores presentaran sus resultados como charlas y afiches en otras secciones concurrentes donde participarán cinco estudiantes graduados de UniAndes. 

Shifting Baselines

Hola todos!!

Nuevamente nos concentraremos en el tema de Resiliencia de ecosistemas marinos y tendremos un foro en SICUA (Tópicos en Ecología Marina) sobre el articulo de "Shifting Baselines" de Nancy Knowlton y Jeremy Jackson del 2008 en PLoS Biology (http://www.plosbiology.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pbio.0060054). El foro es con reglas TIGRE, las cuales tambien estan en SICUA.

Hay un blog al parecer muy popular sobre este tema: http://www.shiftingbaselines.org/

Ojala puedan pasar por Foro y hacer alguna contribución, el que no tenga acceso al SICUA del curso me avisa. Podriamos colgar algunos apartes del Foro en este blog, posteriormente.

Saludos,

Juan A

Se estrena Blog!

Buenas! bienvenidos a todos! los invito a que publiquen todo lo que consideren relevante para el laboratorio!