lunes, 31 de octubre de 2011

Invitación a charlas de BIOMMAR


El Laboratorio de Biología Molecular Marina se complace en invitarlos a tres charlas sobre exploración geoquímica y biológica en el mar profundo, primero este martes 1 de noviembre a partir de las 4 PM en el salón O-302:

"Geochemical Precursors of Life at Deep-sea Hydrothermal Vents: Earth and Beyond", Jill McDermott, PhD candidate in Chemical Oceanography, MIT/WHOI

"Deep-sea Biology and Ocean Exploration in the Age of Genomics", Santiago Herrera, PhD student in Biological Oceanography, MIT/WHOI

Y este jueves 3 de noviembre en el ML-603 a a 1:00 p.m:

Seminario del Departamento de Ciencias Biológicas
 
“Sistemática del coral precioso (Cnidaria: Octocorallia): Discrepancias en la clasificación taxonómica”

Nestor Ardila-Espitia, Estudiante Doctoral, Laboratorio de Biología Molecular Marina
Departamento de Ciencias Biológicas, Universidad de los Andes
 
Los esperamos!

Entrada Libre

sábado, 1 de octubre de 2011

¿Podrá la plasticidad fenotípica llevar a la especiación ecológica?


Esta es la pregunta que nos hacemos mientras cortamos varios metros de tubería de PVC para agua potable en trozos de 6, 5 y 1,5 cm, afortunadamente los codos y las “T”s y ya las venden listas.  Son algunos de los materiales que se necesitan para hacer una serie de experimentos que nos puedan dar pistas para resolver la pregunta: ¿Podrá la plasticidad fenotípica llevar a la especiación ecológica? De hecho una parte de la pregunta, la otra parte la buscaremos dentro del genoma de la especie con que haremos el estudio, el octocoral Pseudopterogorgia bipinnata. Serian unos cuantos frascos de vidrio o unas cuantas materas si el experimento se fuera hacer con la mosca de la fruta o con alguna maleza modelo, pero desafortunadamente las preguntas surgen generalmente de especies que aún no hemos domesticado, o de especies marinas aún mas esquivas de manipular.


La pluma de mar, P. bipinnata, vive en algunos arrecifes coralinos del mar Caribe y se distribuye desde muy poca profundidad hasta mas de 40 metros en las profundidades arrecifales. Hace unos años nos dimos cuenta que las plumas de mar de poca profundidad tenían ramas 10 veces más cortas que las de aguas profundas. Pese a las diferencias entre colonias de una misma especie sus diferencias genéticas reflejaban en su mayoría diferencias entre lugares geográficos pero no entre las diferentes formas de las diferentes profundidades. Ahora estamos trabajando con esta pregunta en Bocas del Toro, Panamá, gracias al auspicio del Instituto Smithsonian. El cambio morfológico en la especie ya no esta en un rango de 40 m, sino tan solo de 7 m, entre 2 y 9 m de profundidad. La respuesta de la especie sorprendentemente es la misma. Muchas de las condiciones, en especial de luz, son muy diferentes entre 2 y 9 m en estos arrecifes de sotavento en Panamá, pero. ¿Podrá un cambio tan corto en profundidad ejercer una presión de selección suficiente para ser un caso de especiación ecológica incipiente?



jueves, 25 de agosto de 2011

¿Cuántas especies hay en la tierra y en el mar?


Liderados por Camilo Mora, biólogo colombiano profesor de Geografía de la Universidad de Hawaii, un grupo de investigadores publicaron en PLoS Biology el estimado más convincente hasta el momento del numero total de especies tanto en tierra como en el mar. Esta aproximación se hizo posible de acuerdo a la proporción de rangos taxonómicos altos (como clase, orden, familia y género) con el de especies, en grupos donde el numero total de especies esta aparentemente bien conocido como son aves y peces. Dada esa proporción, y asumiendo que la mayoría de rangos altos se han ya descubierto en el resto de especies, los autores estiman que hay cerca de 8,7 millones de especies. Esto quiere decir que solo conocemos, y hemos puesto nombre, a tan solo el 14% de las especies. Lo que realmente, como biólogo marino, no me sorprende. En invertebrados marinos, por ejemplo, en donde sin estar dedicado a ello, he descrito cerca de una docena de nuevas especies, algunas de ellas siendo octocorales de varios metros de altura, en las grandes profundidades del Pacifico sur, mientras otras tienen poblaciones de miles de individuos a tan solo unos metros de profundidad en el mar Caribe.

El hallazgo de Mora y colaboradores, aunque no deja de ser una estimación (claramente subestimada cuando se trata de bacterias y arqueas), nos señala claramente que el esfuerzo taxonómico debe acelerarse si queremos llegar a tener una idea de la biodiversidad antes de que gran parte de ésta se extinga por el cambio global y la alteración de los ecosistemas que vivimos en la actualidad. Asimismo, si la mayoría de los fármacos vienen en un inicio de organismos vivos, en especial de plantas, el otro 86% que no conocemos tiene de seguro que tener descubrimientos asombrosos. Por otro lado, cada vez me convenzo mas que el proceso de especiación ha sido también mas acelerado de lo que pensamos. Quizá pensar en especiación ecológica en grupos tan diversos como insectos e invertebrados marinos sea la regla y no la excepción. Eso esta por verse, por ahora manos a la obra a describir especies!


Mora C, Tittensor DP, Adl S, Simpson AGB, Worm B. 2011. How many species are there on earth and in the ocean? PLoS Biol 9(8): e1001127. doi:10.1371/journal.pbio.1001127

lunes, 8 de agosto de 2011

Sustentación de Tesis Doctoral - Jairo Méndez




La Escuela de Posgrado del Departamento de Ciencias Biológicas y el Laboratorio de Biología Molecular Marina tiene el gusto de invitarlos a la sustentación de tesis doctoral del candidato a doctor:

Jairo Andrés Méndez Rico

Jairo AndrésMéndez Rico El título: "IDENTIFICACIÓN Y ANALISIS FILOGENÉTICO DE FLAVIVIRUS DE IMPORTANCIA PARA LA SALUD PÚBLICA EN COLOMBIA".

Director: Juan Armando Sánchez, Ph.D.

Fecha: Miercoles 10 de agosto, hora de 4:00 pm a 6:00 m

Lugar: salón W 101.


Esperamos contar con su presencia.


lunes, 27 de junio de 2011

Jóvenes trabajan para salvar al pez loro

Hola!
Quiero compartir con todos ustedes esta importante noticia (Jóvenes trabajan para salvar al pez loro) en uno de los periodicos mas destacados de la región, El Universal. El equipo BIOMMAR liderado por Juan A. Sánchez, fué un gran apoyo en la ejecución de este proyecto.

Gracias!

jueves, 23 de junio de 2011

Código QR de Biommar

qrcode
Bueno, este el código de respuesta rápida para el URL de biommar. Telefonos y algunas cámaras digitales pueden reconocerlo y dirigirse a esta dirección. Interesante, curioso, útil, aún no lo se pero esta por todas partes...

jueves, 9 de junio de 2011

Rumbo a Oklahoma: Evolution 2011


Durante el 17 al 21 de Junio se celebra en la Universidad de Oklahoma la mayor conferencia mundial sobre Evolución, Evolution 2011. Gracias al apoyo de la Facultad de Ciencias de la Universidad de los Andes, BIOMMAR presentará seis afiches sobre nuestros resultados recientes.

Susana Simancas, quién realizó su tesis de pregrado en biofísica, presentará los resultados de simulaciones de cómo fuerzas hidrodinámicas explican en parte la gran labilidad y plasticidad de los corales bambú. En el mismo grupo de corales, Luisa Dueñas, producto de su tesis de maestría, nos muestra las primeras evidencias de evolución reticulada en este grupo de organismos profundos. Rocío Acuña avanzando en su posgrado, reúne sus resultados en conectividad genética en dos corales de aguas someras de la costa Caribe de Colombia. Iniciando su doctorado, Iván Calixto propone un esquema bioinformático para detectar en el genoma de un octocoral las huellas de la especiación ecológica. Johanna Velásquez, haciendo uso tanto de información ecológica como filogenética, nos presenta los factores que estructuran las comunidades de octocorales en el mar Caribe. Finalmente, presentaré los resultados de una colaboración internacional dentro del proyecto del árbol de la vida de Cnidaria (CnidToL-NSF) en el cual con una corta región nuclear presentamos una robusta filogenia de los corales negros.

Además de la satisfacción de que el grupo presenta sus resultados recientes, nuestras mayores expectativas esta en actualizarnos en diversos campos de la biología evolutiva. Tenemos un gran interés en el simposio sobre adaptación en especial por el gran avance mediante genómica poblacional. Asimismo, el programa del evento incluye excelentes charlas en todas las áreas de la evolución.