sábado, 4 de noviembre de 2017

Biodiversidad, Conservación y Desarrollo: hacia la ruta épsilon



El proyecto de replantear mi curso de Biodiversidad, Conservación y Desarrollo como un curso Épsilon empieza a tomar forma. Este curso es una gran oportunidad de reunir una muestra representativa de todos los estudiantes de la universidad, en realidad he tenido estudiantes de todas las carreras. El curso propicia ambientes interdisciplinarios en los que interactúen las artes, las humanidades, las ciencias y las tecnologías para promover profesionales íntegros, líderes con pensamiento crítico y con principios éticos, que estén en capacidad de afrontar problemas nacionales de proyección universal, entre ellos la pérdida de la biodiversidad, los recursos naturales y la sostenibilidad.

Los temas del curso son fundamentales para la formación integral y la autonomía de cualquier profesional. Claramente es el mayor desafío del proyecto Épsilon es cómo evaluar el componente ético junto al curricular. No obstante, lo veo compatible con la forma como lo he estado evaluando. Donde los talleres (grupos de trabajo dirigidos en clase) incluirían el componente de debate ético los cuales se realizan sobre 5 temas diferentes. Este componente es un requisito de asistencia, que creo debe ser su espíritu. Con lo que concuerdo con los documentos guía para esto.

En general la idea de que sea un curso épsilon me parece bien encaminada, sin ofrecer una dirección moral, invita a afrontar problemas, debates y situaciones donde la ética es más una reflexión que un dogma. Digamos que venía haciéndolo de manera implícita en el curso por lo que adaptarlo a la estrategia será un proceso natural. Aunque la preconcepción es que lo ético es la razón consensuada, la reflexión puede generar una apropiación más duradera en la enseñanza sobre la ética.

Cada vez es más común el choque entre conservación y desarrollo, lo cual es el corazón del CBU Biodiversidad, Conservación y Desarrollo. En un país megadiverso como Colombia, las decisiones que afectan al medio ambiente, no solo comprometen la base natural de la región con más especies por km2 del mundo, sino la base natural para desarrollo sostenible y una potencial bioeconomía. El curso es por tanto un lienzo ideal para trabajar el debate tanto técnico como ético del balance entre conservación y desarrollo.

martes, 2 de julio de 2013

Buenas noticias para investigadores en Biodiversidad Biológica: nueva reglamentación para colecciones biológicas y recolección de especímenes



Desde Junio tenemos en Colombia nueva reglamentación para Colecciones Biológicas y recolección de especímenes silvestres. Esto simplifica notablemente los trámites de solicitud de colecta especímenes biológicos y también facilita el acceso a recurso genético; todo sin fines comerciales ni de bioprospección.

Gracias Colombia!!

domingo, 19 de mayo de 2013

Sustentación Doctoral Nestor Ardila, Martes 21, 9 am, ML-606, UniAndes


"Systematics and phylogeography of the precious corals (Cnidaria: Octocorallia: Coralliidae)"

Sustentación de tesis Doctoral

Presentada por: Nestor Ardila

Foto: NOAA


Escuela de Posgrados
Departamento de Ciencias Biológicas
Universidad de los Andes
Fecha: Martes 21 de mayo de 2013
Hora: 9:00 A.M.
Lugar: ML-606

martes, 18 de diciembre de 2012

Perspectivas de la Ecología de Arrecifes Coralinos


Sánchez J.A & J. López-Angarita (eds). 2012. Perspectivas en la Ecología de los Arrecifes Coralinos. Universidad de los Andes, Colección Ciclo Básico, Ediciones UniAndes. Bogotá, 348 pp. ISBN 978-958-695-825-7


Contenidos




Disponible también en:

Librería Universidad de los Andes
Carrera 1 No 19 -27. Edificio Aulas Primer Piso. Entrada por el eje ambiental
Horario: Lunes a viernes jornada continua de 7 a.m. a 7 p.m., sábados de 9:00 a.m. a 12:30 p.m.
Conmutador (57-1) 3 394949/99 . Ext.: 2181. Telefax: Ext.: 3177
E-mail: libreria@uniandes.edu.co

jueves, 30 de agosto de 2012

Assistant/Associate Professor - Computational Biology or Bioinformatics : Bogotá, Colombia


UNIVERSIDAD DE LOS ANDES

Computational Biology or Bioinformatics



The Department of Biological Sciences (DCB) at the Universidad de los Andes in Bogotá, Colombia, seeks to fill a full-time position in Computational Biology or Bioinformatics at the Assistant or Associate Professor level. The successful applicant must possess a Ph.D., preferably with postdoctoral experience and a successful track record of scientific productivity. The candidate will be expected to promote and lead research projects in his/her area of expertise. We especially encourage applicants with research interests and experience in evolutionary biology and genomics.

The successful candidate will be expected to teach an undergraduate course in basic cellular biology and/or computational biology/bioinformatics, along with graduate courses in his or her area of expertise. The expected teaching load will be 2 courses per semester (1 per semester during the first year). The candidate will advise undergraduate, masters and doctoral students in the DCB. The University will soon launch an interdisciplinary Masters Program in Computational Biology sponsored jointly by the schools of Engineering and Science, and we look forward to the successful candidate taking a leadership role in this new program.

Universidad de los Andes is ranked among the top universities in Latin America. The DCB hosts 27 full-time faculty with internationally recognized research programs in evolutionary genetics, tropical parasitology, microbial genomics, phylogeography, bioinformatics, evolutionary ecology, human genetics, and molecular systematics. The successful candidate will have his or her own lab space, basic computational infrastructure consisting of two compute clusters with 136 cores and approx. 300GB RAM in total, as well as access to a centralized DNA sequencing facility and confocal microscope and SEM. The Biology faculty is relatively young, dynamic and growing rapidly. The University offers diverse sources of financing for professors and graduate student research. For more information visit: http://dcb.uniandes.edu.co/

Interested candidates should send a curriculum vitae, a description of her or his research program, and a teaching statement (as a single PDF) to the following email address: ccontbio@uniandes.edu.co

Deadline for receipt of material is October 31st, 2012. Preferred candidates will then be asked to submit letters of recommendation and copies of recent publications.

For additional information, please contact:

Juan Armando Sánchez, PhD.
Associate Professor
Department of Biological Sciences
Universidad de los Andes
Tel. +57 1 339-4949 ext 3756
Email: juansanc@uniandes.edu.co

jueves, 17 de mayo de 2012

Biodiversidad, conservación y desarrollo ISBN 978-958-695-717-5




Sánchez, J.A. & S. Madriñán (compiladores). 2012. Biodiversidad, conservación y desarrollo. Colección Ciclo Básico, Ediciones Uniandes. 468 pp.; 17x24 cm.
ISBN 978-958-695-717-5
Dewey CCD. 333.716

Disponible también en:

Librería Universidad de los Andes
Carrera 1 No 19 -27. Edificio Aulas Primer Piso. Entrada por el eje ambiental
Horario: Lunes a viernes jornada continua de 7 a.m. a 7 p.m., sábados de 9:00 a.m. a 12:30 p.m.
Conmutador (57-1) 3 394949/99 . Ext.: 2181. Telefax: Ext.: 3177
E-mail: libreria@uniandes.edu.co



martes, 27 de marzo de 2012

¿Qué tanto conocemos nuestra biodiversidad? - Editorial - Revista HipÓtesis No. 12



[EDITORIAL de la Revista Hipótesis 12, Facultad de Ciencias, Universidad de los Andes - Ediciones UniAndes © 2005-2012]

¿Qué tanto conocemos nuestra biodiversidad? 

Como profesor de un curso del Ciclo Básico (Biodiversidad, Conservación y Desarrollo) que incluye una muestra representativa de todas las carreras de la universidad, en una de mis clases preferidas hago una reflexión al inicio del semestre sobre nuestro conocimiento de la biodiversidad de Colombia en comparación con otras regiones del mundo. Esta clase inicia con un ejercicio sencillo y divertido, donde presento a los estudiantes, en paralelo, videos cortos de animales que se encuentran en Colombia y otros que están en otros continentes, para que entre todos recordemos sus nombres. Después de más de seis años de hacer este ejercicio el resultado es el mismo. Cuando aparecen las imágenes de los animales de África, Asia o Europa, muchos estudiantes se adelantan dentro de los primeros milisegundos e interrumpen contestando: “oso panda”, “cebra”, “pingüino”, “orangután”, “lémur”,  este último algunas veces genera risas y comentarios sobre el personaje Sabú mafú del Discovery Channel. Sin embargo, mientras nos concentramos en los videos de animales de nuestra región, como el yaguarundi, el ocelote, el ocarro, el churuco, el perro de monte y la paca, entre otros, hay un silencio profundo en el aula. Algunos con cierta timidez logran distinguir el oso de anteojos, el erizo marino, la guacamaya y el mico tití, pero si hacemos un balance, tenemos un conocimiento perfecto de la fauna carismática de otros continentes y nos rajamos en la de nuestro país. Continúo la clase presentando cifras que ubican a Colombia entre los primeros países megadiversos del mundo.

Pese a que vivimos en un país con más especies de aves y ranas que cualquier otro, asimismo con cientos de mamíferos y decenas de miles de plantas, en nuestras experiencias pasadas la interacción con esta megadiversidad ha sido escasa, si no, ausente. ¿Cuántas especies de plantas o animales nativos conoce un colombiano promedio?

Este ejercicio siempre ha generado una retroalimentación muy positiva dentro del curso, aumentando el interés  y la motivación  por  el tema. También es uno de los pocos mensajes que sé que, tras los años, los estudiantes recuerdan. Por otro lado, el ejercicio es un indicador de que podemos hacer más por lo que puede ser la clave para el desarrollo sostenible de nuestro país: la biodiversidad.

Este número especial de Hipótesis presenta el momento histórico de la actividad en biodiversidad durante el 2010 en la Universidad de los Andes. Cuando se me adjudicó la tarea de ser el editor de este número, lo primero que se me vino a la cabeza fue el problema que han tenido editores anteriores para reclutar artículos y contribuciones. Afortunadamente, esto no fue un problema en esta oportunidad. De hecho, la tarea difícil ha sido todo lo contrario, organizar de la mejor manera tanto y tan buen material; esto gracias a la celebración durante el 2010 del Año Internacional de la Biodiversidad en la Universidad de los Andes. Sobre este evento, Catalina González hace referencia más adelante, quien además diligentemente lideró su organización. Gracias a esto, contamos con resúmenes de casi todos los ponentes nacionales e internacionales, así como artículos cortos de varios participantes  del evento. El rango  de las contribuciones  es enorme,  así como  lo es la biodiversidad. Dentro del mismo evento, un esfuerzo liderado por Santiago Madriñán, coordinador del Museo de Historia  Natural  (ANDES), describe  en detalle  el repositorio de biodiversidad presente hoy en día en la Universidad de los Andes. Siendo el museo un proyecto tan reciente, es sorprendente el cubrimiento de organismos que tiene actualmente, así como la fuerte sinergia con la docencia e investigación  en biodiversidad que se realiza en la Facultad de Ciencias. Estos apuntes científicos, todos con el eje central de la biodiversidad y su problemática actual, además de ser una fuente de divulgación de las ciencias, que ha caracterizado a Hipótesis, son una muestra representativa de las tendencias de investigación en esta área.

El lector de este número encontrará una muestra representativa de la situación actual en biodiversidad, que se puede reducir a dos tendencias: descubrimientos y amenazas. La biodiversidad es ahora más que nunca una fuente, casi sin límites, de nuevos descubrimientos.  La biodiversidad de especies —la escala de estudio más sencilla en esta área— para muchos grupos de organismos, y en especial de microorganismos, está aún por determinarse, así como el origen de dicha biodiversidad, en especial en lugares tan megadiversos como Colombia, pues hasta ahora se están empezando a revelar los procesos evolutivos que han llevado a la formación de nuevas especies. Nuevas tecnologías para acceder a otras escalas de la biodiversidad, como la genómica y bioinformática, están develando los misterios más profundos de la biología de los organismos vivos. Sin embargo, por estos mismos días la biodiversidad está más amenazada que nunca: la degradación ambiental, en todas sus dimensiones, producto de un desarrollo desenfrenado, está ocasionando extinciones de especies y la pérdida de ecosistemas tanto marinos como terrestres. Más preocupante aún es la pérdida de los valiosos servicios ecosistémicos esenciales para la vida cotidiana: agua potable, aire puro, alimentos, productos, fármacos naturales, entre otros.

Finalmente, quiero agradecer de manera especial a los contribuyentes de este número por sus valiosos aportes. Particularmente, quisiera agradecer a Catalina González, así como al comité editorial, en especial a Manuel Antonio Romero, Santiago Madriñan,  Manu Forero y Carlos Montenegro. A Ediciones Uniandes y Felipe Castañeda por su asesoría. Igualmente, lo correspondiente a todo el equipo de la decanatura de la Facultad de Ciencias por su compromiso incondicional con la revista.


Juan Armando Sánchez M., Ph. D. / Director de Investigaciones y Posgrados 2009-2011  / Facultad de Ciencias (editor encargado)

[Revista HipÓtesis de distribución gratuita en la Facultad de Ciencias, Universidad de los Andes, Bogotá, Colombia; informes: facciencias@uniandes.edu.co]

viernes, 2 de diciembre de 2011

Teaching Postdoc Position - Universidad de los Andes



The Department of Biological Science (DCB) at the Universidad de los Andes (Bogotá, Colombia) seeks to fill two positions as teaching postdoctoral researchers. The selected candidates will serve as full-time visiting professors with a contract for 12 months (renewable for a second year) starting August 1st, 2012. Applicants must possess a Ph.D. before the starting date. Preferences will be given to candidates interested in affiliating himself or herself with an existing lab within the DCB (see http://dcb.uniandes.edu.co/).

We seek candidates interested in developing and promoting new research perspectives within the DCB via collaboration with one or more professors or via independent research. The selected candidates should also be willing to act as an advisor or mentor to undergraduate and/or graduate students. Teaching responsibilities include one undergraduate non-majors course in ecology or cellular biology (depending on the expertise of the postdoc) each semester, plus some teaching duties for one month during the annual break (Boreal summer). The selected candidate may choose to offer or participate in additional courses or workshops in areas of his or her interest.

The teaching postdoc position is guaranteed for the first year, with an optional second year conditional upon satisfactory performance and available funding.
Interest persons should send a cover letter, CV and two recommendation letters to the email address by January 15, 2012, to the address below.

Comité de Selección Profesoral
Departamento de Ciencias Biológicas
Universidad de Los Andes
Carrera 1 No. 18A-12
Apartado Aéreo 4976
Bogotá, Colombia
Email: ccontbio@uniandes.edu.co
Webpage: http://dcb.uniandes.edu.co/

(research available for postdocs at BIOMMAR)


Universidad de los Andes - Posición Postdoctoral con Docencia

El Departamento de Ciencias Biológicas (DCB) de la Universidad de los Andes (Bogotá, Colombia) ofrece posiciones para dos investigadores-docentes postdoctorales, que se vincularían como profesores visitantes de tiempo completo por un año, a partir del segundo semestre de 2012. Los aspirantes deben poseer título de Ph.D. y se dará preferencia a aquellos investigadores que tengan interés en vincularse a algún grupo de investigación del DCB para su estancia postdoctoral (ver http://dcb.uniandes.edu.co/).
Se espera que el candidato seleccionado fomente nuevas perspectivas y enfoques de investigación científica en el DCB, mediante investigaciones independientes o colaborativas, en asocio con uno o varios profesores del DCB. El candidato seleccionado también actuará como colega de otros profesores y como mentor para estudiantes de pregrado y posgrado. Las responsabilidades docentes de la posición incluyen dictar un curso introductorio de ecología o biología celular (dependiendo de la experiencia del profesor visitante) para estudiantes de carreras distintas a Biología, en cada uno de los semestres académicos del año, así como un mes durante el período intersemestral. El profesor visitante además podrá dictar cursos o talleres adicionales en temas que sean de su interés.

La posición se ofrece por un año, con la posibilidad de extenderse a un año adicional, dependiendo del desempeño del investigador y de la situación presupuestal. Los candidatos deberán estar en disposición de iniciar actividades el 1 de agosto de 2012.

Enviar una carta de presentación, hoja de vida y dos cartas de recomendación antes del 15 de enero de 2012, a la dirección que se muestra a continuación:

Comité de Selección Profesoral
Departamento de Ciencias Biológicas
Universidad de los Andes
Carrera 1 No. 18A-12
Apartado Aéreo 4976
Bogotá, Colombia
ccontbio@uniandes.edu.co

(cupos disponibles para postdocs en BIOMMAR)

viernes, 11 de noviembre de 2011

Foro de la Facultad de Ciencias - UniAndes


Nos complace invitarlos al foro de la Facultad de Ciencias, que en esta oportunidad será el martes de la semana entrante 15 de noviembre de 2:00  a 7:00 p.m en el auditorio Mario Laserna-A, Universidad de los Andes, Bogotá, Colombia.

Tenemos un programa aumentado en esta ocasión:

2:00 – 2:45 Año internacional de la Química
"Cómo nos envejecemos y por qué"
James Weston, Ph.D.
Departamento de Química – Universidad de los Andes
2:45 – 4:15 Charlas de los mejores proyectos de investigación de la Facultad de Ciencias
Premiación
4:15 – 5:00 Entrega premio al docente distinguido "Aldona Gabriunas"
Conferencia ganador
5:00 – 5:45 Entrega premio a la Investigación  Distinguida "Elizabeth Grose"
Conferencia ganador
6:00 Coctel

lunes, 31 de octubre de 2011

Invitación a charlas de BIOMMAR


El Laboratorio de Biología Molecular Marina se complace en invitarlos a tres charlas sobre exploración geoquímica y biológica en el mar profundo, primero este martes 1 de noviembre a partir de las 4 PM en el salón O-302:

"Geochemical Precursors of Life at Deep-sea Hydrothermal Vents: Earth and Beyond", Jill McDermott, PhD candidate in Chemical Oceanography, MIT/WHOI

"Deep-sea Biology and Ocean Exploration in the Age of Genomics", Santiago Herrera, PhD student in Biological Oceanography, MIT/WHOI

Y este jueves 3 de noviembre en el ML-603 a a 1:00 p.m:

Seminario del Departamento de Ciencias Biológicas
 
“Sistemática del coral precioso (Cnidaria: Octocorallia): Discrepancias en la clasificación taxonómica”

Nestor Ardila-Espitia, Estudiante Doctoral, Laboratorio de Biología Molecular Marina
Departamento de Ciencias Biológicas, Universidad de los Andes
 
Los esperamos!

Entrada Libre

sábado, 1 de octubre de 2011

¿Podrá la plasticidad fenotípica llevar a la especiación ecológica?


Esta es la pregunta que nos hacemos mientras cortamos varios metros de tubería de PVC para agua potable en trozos de 6, 5 y 1,5 cm, afortunadamente los codos y las “T”s y ya las venden listas.  Son algunos de los materiales que se necesitan para hacer una serie de experimentos que nos puedan dar pistas para resolver la pregunta: ¿Podrá la plasticidad fenotípica llevar a la especiación ecológica? De hecho una parte de la pregunta, la otra parte la buscaremos dentro del genoma de la especie con que haremos el estudio, el octocoral Pseudopterogorgia bipinnata. Serian unos cuantos frascos de vidrio o unas cuantas materas si el experimento se fuera hacer con la mosca de la fruta o con alguna maleza modelo, pero desafortunadamente las preguntas surgen generalmente de especies que aún no hemos domesticado, o de especies marinas aún mas esquivas de manipular.


La pluma de mar, P. bipinnata, vive en algunos arrecifes coralinos del mar Caribe y se distribuye desde muy poca profundidad hasta mas de 40 metros en las profundidades arrecifales. Hace unos años nos dimos cuenta que las plumas de mar de poca profundidad tenían ramas 10 veces más cortas que las de aguas profundas. Pese a las diferencias entre colonias de una misma especie sus diferencias genéticas reflejaban en su mayoría diferencias entre lugares geográficos pero no entre las diferentes formas de las diferentes profundidades. Ahora estamos trabajando con esta pregunta en Bocas del Toro, Panamá, gracias al auspicio del Instituto Smithsonian. El cambio morfológico en la especie ya no esta en un rango de 40 m, sino tan solo de 7 m, entre 2 y 9 m de profundidad. La respuesta de la especie sorprendentemente es la misma. Muchas de las condiciones, en especial de luz, son muy diferentes entre 2 y 9 m en estos arrecifes de sotavento en Panamá, pero. ¿Podrá un cambio tan corto en profundidad ejercer una presión de selección suficiente para ser un caso de especiación ecológica incipiente?



jueves, 25 de agosto de 2011

¿Cuántas especies hay en la tierra y en el mar?


Liderados por Camilo Mora, biólogo colombiano profesor de Geografía de la Universidad de Hawaii, un grupo de investigadores publicaron en PLoS Biology el estimado más convincente hasta el momento del numero total de especies tanto en tierra como en el mar. Esta aproximación se hizo posible de acuerdo a la proporción de rangos taxonómicos altos (como clase, orden, familia y género) con el de especies, en grupos donde el numero total de especies esta aparentemente bien conocido como son aves y peces. Dada esa proporción, y asumiendo que la mayoría de rangos altos se han ya descubierto en el resto de especies, los autores estiman que hay cerca de 8,7 millones de especies. Esto quiere decir que solo conocemos, y hemos puesto nombre, a tan solo el 14% de las especies. Lo que realmente, como biólogo marino, no me sorprende. En invertebrados marinos, por ejemplo, en donde sin estar dedicado a ello, he descrito cerca de una docena de nuevas especies, algunas de ellas siendo octocorales de varios metros de altura, en las grandes profundidades del Pacifico sur, mientras otras tienen poblaciones de miles de individuos a tan solo unos metros de profundidad en el mar Caribe.

El hallazgo de Mora y colaboradores, aunque no deja de ser una estimación (claramente subestimada cuando se trata de bacterias y arqueas), nos señala claramente que el esfuerzo taxonómico debe acelerarse si queremos llegar a tener una idea de la biodiversidad antes de que gran parte de ésta se extinga por el cambio global y la alteración de los ecosistemas que vivimos en la actualidad. Asimismo, si la mayoría de los fármacos vienen en un inicio de organismos vivos, en especial de plantas, el otro 86% que no conocemos tiene de seguro que tener descubrimientos asombrosos. Por otro lado, cada vez me convenzo mas que el proceso de especiación ha sido también mas acelerado de lo que pensamos. Quizá pensar en especiación ecológica en grupos tan diversos como insectos e invertebrados marinos sea la regla y no la excepción. Eso esta por verse, por ahora manos a la obra a describir especies!


Mora C, Tittensor DP, Adl S, Simpson AGB, Worm B. 2011. How many species are there on earth and in the ocean? PLoS Biol 9(8): e1001127. doi:10.1371/journal.pbio.1001127

lunes, 8 de agosto de 2011

Sustentación de Tesis Doctoral - Jairo Méndez




La Escuela de Posgrado del Departamento de Ciencias Biológicas y el Laboratorio de Biología Molecular Marina tiene el gusto de invitarlos a la sustentación de tesis doctoral del candidato a doctor:

Jairo Andrés Méndez Rico

Jairo AndrésMéndez Rico El título: "IDENTIFICACIÓN Y ANALISIS FILOGENÉTICO DE FLAVIVIRUS DE IMPORTANCIA PARA LA SALUD PÚBLICA EN COLOMBIA".

Director: Juan Armando Sánchez, Ph.D.

Fecha: Miercoles 10 de agosto, hora de 4:00 pm a 6:00 m

Lugar: salón W 101.


Esperamos contar con su presencia.


lunes, 27 de junio de 2011

Jóvenes trabajan para salvar al pez loro

Hola!
Quiero compartir con todos ustedes esta importante noticia (Jóvenes trabajan para salvar al pez loro) en uno de los periodicos mas destacados de la región, El Universal. El equipo BIOMMAR liderado por Juan A. Sánchez, fué un gran apoyo en la ejecución de este proyecto.

Gracias!